Lantmännens verksamhet är organiserad i åtta affärsområden med huvudinriktningen Livsmedel, Energi och Lantbruk.

Ett av koncernens mål är att skapa en väl sammanhållen verksamhet som på bästa sätt utnyttja styrkan i hela värdekedjan samt tillvaratar synergier och skalfördelar.

Vissa av Lantmännens affärsområden har dessutom koncerngemensamma uppdrag; till exempel ansvarar Lantmännen Lantbruk för den övergripande logistikfunktionen inom koncernen och Lantmännen Energi för koncernens energifrågor.

Lantmännen har koncerngemensamma funktioner inom Ekonomi & Finans, Information & Kommunikation, Juridik & Ägarrelationer, Human Resources samt Internrevision. Funktionernas uppdrag är att stödja koncernledningen och affärsområdena i koncerngemensamma frågor.