Lantmännens verksamhet är organiserad i fyra divisioner med huvudinriktningen Lantbruk, Maskin, Energi och Livsmedel.

Ett av koncernens mål är att skapa en väl sammanhållen verksamhet som på bästa sätt utnyttja styrkan i hela värdekedjan samt tillvaratar synergier och skalfördelar.

Vissa delar av Lantmännens divisioner har dessutom koncerngemensamma uppdrag; till exempel ansvarar Lantmännen Energi för koncernens energifrågor.

Lantmännen har koncerngemensamma funktioner inom Ekonomi & Finans, Information & Kommunikation, Juridik & Ägarrelationer, Varuflöde, Human Resources samt Internrevision. Funktionernas uppdrag är att stödja koncernledningen och affärsområdena i koncerngemensamma frågor.